Костарева Анна Александровна

Заведующий НИЛ молекулярного и клеточного моделирования и генной терапии НЦМУ «Центр персонализированной медицины»,

доцент кафедры внутренних болезней Института медицинского образования Центра Алмазова, д.м.н.

Индекс Хирша — 17 (РИНЦ), число публикаций — 280, РИНЦ Author ID: 610181,
Индекс Хирша (WOS) — 15, число публикаций — 150, WOS Research ID: AAO-5429—2020,
Индекс Хирша (Scopus) — 16, число публикаций —135, Scopus Author ID: 8906596800.
ORCID ID: 0000-0002-9349-6257.

Основные научные интересы: поиск и экспериментальное изучение молекулярно-генетических механизмов развития первичных кардиомиопатий.

Образование

В 1999 году окончила лечебный факультет СПбГМУ им. акад. И. П. Павлова.
С 1999 по 2000 годы обучалась в интернатуре на кафедре факультетской терапии с курсом эндокринологии и гематологии по специальности «Терапия».
С 2000 по 2002 годы обучалась в ординатуре на кафедре факультетской терапии с курсом эндокринологии и гематологии по специальности «Терапия».
В 2005 году окончила очную аспирантуру на кафедре факультетской терапии СПбГМУ им. акад. И. П. Павлова.
С 2001 по 2007 годы обучалась в Каролинском медицинском институте г. Стокгольма, Швеция (Karolinska Institutet, Stockholm) (Postgraduate study).

В 2016 году получила степень кандидата медицинских наук после защиты диссертации на тему «Роль десмина в развитии кардиомиопатий и миопатий», по специальности 14.00.06 — «Кардиология».

В 2007 году защитила международную степень PhD в Каролинском медицинском институте г. Стокгольма, Швеция (Karolinska Institutet, Stockholm). Тема диссертационного исследования «Genetic and pathophysiological study of desmin derangements in cardiac disorders».

В 2020 году получила степень доктора медицинских наук после защиты диссертации на тему «Молекулярно-генетические механизмы развития идиопатической рестриктивной кардиомиопатии» по специальностям 14.01.05 — «Кардиология» и 03.02.07 — «Генетика», медицинские науки.

Членство в отечественных и международных организациях

Член редакционной коллегии журнала «Трансляционная медицина».

Член редакционной коллегии журнала Cardiology.

Почетный член Европейского общества кардиологов (ECO) и Рабочей группы по заболеваниям миокарда и перикарда (Myocardial and Pericardial disorders).

Участие в проектах

Руководитель государственного задания по теме «Разработка и внедрение новых молекулярно-генетических и протеомных подходов для диагностики первичных и вторичных кардиомиопатий с целью подбора персонифицированной терапии и прогнозирования».

Участие в грантах

В качестве руководителя:

«Роль цитоскелетных и Z-диск ассоциированных белков в патогенезе заболеваний миокарда и скелетной мускулатуры»
№ соглашения о гранте: 20-15-00271
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ
Сроки выполнения: 2020—2022 гг.
«Механизмы участия ламина А в дифференцировке стволовых клеток»
№ соглашения о гранте: 19-015-00313
Название фонда, предоставляющего грант: РФФИ
Сроки выполнения: 2019—2021 гг.

В качестве соисследователя:

«Структурно-молекулярные механизмы дисфункции канала Nav1.5 в миокарде»
№ соглашения о гранте: 17-15-01292
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ
Сроки выполнения: 2019 г.
«Изучение влияния мутаций гена десмина на функциональные и структурные особенности митохондрий, а также на процесс аутофагии в патогенезе кардиомиопатий»
№ соглашения о гранте: 14-15-00745
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ
Сроки выполнения: 2014—2018 гг.
«Генетическое и патофизиологическое исследование роли белков цитоскелета в патогенезе кардиомиопатий»
Название фонда, предоставляющего грант: ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России»
Сроки выполнения: 2009—2011 гг.
«Роль белков сократительного аппарата мышечной клетки в возникновении врожденных пороков сердца»
Название фонда, предоставляющего грант: ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России»
Сроки выполнения: 2010—2012 гг.
«Характеристика поведения мышечных клеток in vivo, in vitro и ex vivo в системах, моделирующих развитие патологических состояний сердечно-сосудистой системы»
Название фонда, предоставляющего грант: ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России»
Сроки выполнения: 2011—2013 гг.
«Молекулярные и клеточные механизмы развития ламинопатий»
Название фонда, предоставляющего грант: ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России»
Сроки выполнения: 2012—2013 годы
«Применение технологии индуцированных плюрипотентных клеток для изучения патогенеза миопатий и кардиомиопатий, ассоциированных с мутациями гена десмина»
Название фонда, предоставляющего грант: ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России»
Сроки выполнения: 2012—2013 гг.
«Методы трансляционной медицины при изучении патогенеза сердечно-сосудистых заболеваний»
Название фонда, предоставляющего грант: ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России»
Сроки выполнения: 2012—2013 гг.
Разработка молекулярно-генетических тест-систем для диагностики редких генетически обусловленных заболеваний детского возраста «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технического комплекса России на 2007—2013 гг.»

Основные публикации

Smolina N, Khudiakov A, Knyazeva A, Zlotina A, Sukhareva K, Kondratov K, Gogvadze V, Zhivotovsky B, Sejersen T, Kostareva A.Desmin mutations result in mitochondrial dysfunction regardless of their aggregation properties. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis. 2020 Jun 1;1866(6):165745. doi: 10.1016/j.bbadis.2020.165745. Epub 2020 Feb 25.PMID: 32105824
Ignatieva EV, Ivanova OA, Komarova MY, Khromova NV, Polev DE, Kostareva AA, Sergushichev A, Dmitrieva RI.LMNA Mutations G232E and R482L Cause Dysregulation of Skeletal Muscle Differentiation, Bioenergetics, and Metabolic Gene Expression Profile. Genes (Basel). 2020 Sep 7;11(9):E1057. doi: 10.3390/genes11091057.
Khudiakov A, Zaytseva A, Perepelina K, Smolina N, Pervunina T, Vasichkina E, Karpushev A, Tomilin A, Malashicheva A, Kostareva A. Sodium current abnormalities and deregulation of Wnt/β-catenin signaling in iPSC-derived cardiomyocytes generated from patient with arrhythmogenic cardiomyopathy harboring compound genetic variants in plakophilin 2 gene. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis. 2020 Nov 1;1866(11):165915.
Gusev K, Khudiakov A, Zaytseva A, Perepelina K, Makeenok S, Kaznacheyeva E, Kostareva A. Impact of the DSP-H1684R Genetic Variant on Ion Channels Activity in iPSC-Derived Cardiomyocytes. Cell Physiol Biochem. 2020 Jul 25;54(4):696-706. doi: 10.33594/000000249.
Kondratov K, Nikitin Y, Fedorov A, Kostareva A, Mikhailovskii V, Isakov D, Ivanov A, Golovkin A. Heterogeneity of the nucleic acid repertoire of plasma extracellular vesicles demonstrated using high-sensitivity fluorescence-activated sorting. J Extracell Vesicles. 2020 Mar 30;9(1):1743139. doi: 10.1080/20013078.2020.1743139.
Cimiotti D, Fujita-Becker S, Möhner D, Smolina N, Budde H, Wies A, Morgenstern L, Gudkova A, Sejersen T, Sjöberg G, Mügge A, Nowaczyk MM, Reusch P, Pfitzer G, Stehle R, Schröder RR, Mannherz HG, Kostareva A, Jaquet K. Infantile restrictive cardiomyopathy: cTnI-R170G/W impair the interplay of sarcomeric proteins and the integrity of thin filaments. PLoS One. 2020 Mar 17;15(3):e0229227. doi: 10.1371/journal.pone.0229227.
Barbitoff YA, Polev DE, Glotov AS, Serebryakova EA, Shcherbakova IV, Kiselev AM, Kostareva AA, Glotov OS, Predeus AV. Systematic dissection of biases in whole-exome and whole-genome sequencing reveals major determinants of coding sequence coverage. Sci Rep. 2020 Feb 6;10(1):2057. doi: 10.1038/s41598-020-59026-y.
Klauzen P, Perepelina K, Khudiakov A, Zlotina A, Fomicheva Y, Pervunina T, Vershinina T, Kostareva A, Malashicheva A. Generation of two induced pluripotent stem cell lines (FAMRCi005-A and FAMRCi005-B) from patient carrying genetic variant LMNA p.Asp357Val. Stem Cell Res. 2020 Mar;43:101719. doi: 10.1016/j.scr.2020.101719.
Khudiakov A, Perepelina K, Klauzen P, Zlotina A, Gusev K, Kaznacheyeva E, Malashicheva A, Kostareva A. Generation of two iPSC lines (FAMRCi004-A and FAMRCi004-B) from patient with familial progressive cardiac conduction disorder carrying genetic variant DSP p.His1684Arg. Stem Cell Res. 2020 Mar;43:101720. doi: 10.1016/j.scr.2020.101720.
Generation of two iPSC lines (FAMRCi006-A and FAMRCi006-B) from patient with dilated cardiomyopathy and Emery-Dreifuss muscular dystrophy associated with genetic variant LMNAp.Arg527Pro. Perepelina K, Klauzen P, Khudiakov A, Zlotina A, Fomicheva Y, Rudenko D, Gordeev M, Sergushichev A, Malashicheva A, Kostareva A. Stem Cell Res. 2020 Mar;43:101714. doi: 10.1016/j.scr.2020.101714.
Kozyrev I, Dokshin P, Kostina A, Kiselev A, Ignatieva E, Golovkin A, Pervunina T, Grekhov E, Gordeev M, Kostareva A, Malashicheva A. Dysregulation of Notch signaling in cardiac mesenchymal cells of patients with tetralogy of Fallot. Pediatr Res. 2020 Jan 17. doi: 10.1038/s41390-020-0760-6.
Malashicheva A, Kostina A, Kostareva A, Irtyuga O, Gordeev M, Uspensky V. Notch signaling in the pathogenesis of thoracic aortic aneurysms: A bridge between embryonic and adult states. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis. 2020 Mar 1;1866(3):165631. doi: 10.1016/j.bbadis.2019.165631.
Dose-dependent mechanism of Notch action in promoting osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells. Semenova D, Bogdanova M, Kostina A, Golovkin A, Kostareva A, Malashicheva A.Cell Tissue Res. 2020 Jan;379(1):169-179. doi: 10.1007/s00441-019-03130-7.
Lelyavina TA, Galenko VL, Ivanova OA, Komarova MY, Ignatieva EV, Bortsova MA, Yukina GY, Khromova NV, Sitnikova MY, Kostareva AA, Sergushichev A, Dmitrieva RI.Clinical Response to Personalized Exercise Therapy in Heart Failure Patients with Reduced Ejection Fraction is Accompanied by Skeletal Muscle Histological Alterations. Int J Mol Sci. 2019 Nov 5;20(21):5514. doi: 10.3390/ijms20215514.
Bogdanova M, Zabirnyk A, Malashicheva A, Enayati KZ, Karlsen TA, Kaljusto ML, Kvitting JP, Dissen E, Sullivan GJ, Kostareva A, Stensløkken KO, Rutkovskiy A, Vaage J.Interstitial cells in calcified aortic valves have reduced differentiation potential and stem cell-like properties.Sci Rep. 2019 Sep 10;9(1):12934. doi: 10.1038/s41598-019-49016-0.
Aquila G, Kostina A, Vieceli Dalla Sega F, Shlyakhto E, Kostareva A, Marracino L, Ferrari R, Rizzo P, Malaschicheva A.The Notch pathway: a novel therapeutic target for cardiovascular diseases? Expert Opin Ther Targets. 2019 Aug;23(8):695-710. doi: 10.1080/14728222.2019.1641198.
Kiselev A, Vaz R, Knyazeva A, Sergushichev A, Dmitrieva R, Khudiakov A, Jorholt J, Smolina N, Sukhareva K, Fomicheva Y, Mikhaylov E, Mitrofanova L, Predeus A, Sjoberg G, Rudenko D, Sejersen T, Lindstrand A, Kostareva A. Truncating Variant in Myof Gene Is Associated With Limb-Girdle Type Muscular Dystrophy and Cardiomyopathy. Front Genet. 2019 Jun 26;10:608. doi: 10.3389/fgene.2019.00608.
Zaytseva AK, Karpushev AV, Kiselev AM, Mikhaylov EN, Lebedev DS, Zhorov BS, Kostareva AA.Characterization of a novel SCN5A genetic variant A1294G associated with mixed clinical phenotype. Biochem Biophys Res Commun. 2019 Aug 27;516(3):777-783. doi: 10.1016/j.bbrc.2019.06.080.
Kostina A, Semenova D, Kostina D, Uspensky V, Kostareva A, Malashicheva A. Human aortic endothelial cells have osteogenic Notch-dependent properties in co-culture with aortic smooth muscle cells. Biochem Biophys Res Commun. 2019 Jun 25;514(2):462-468. doi: 10.1016/j.bbrc.2019.04.177.
Fedorov A, Kondratov K, Kishenko V, Mikhailovskii V, Kudryavtsev I, Belyakova M, Sidorkevich S, Vavilova T, Kostareva A, Sirotkina O, Golovkin A.Application of high-sensitivity flow cytometry in combination with low-voltage scanning electron microscopy for characterization of nanosized objects during platelet concentrate storage. Platelets. 2020;31(2):226-235. doi: 10.1080/09537104.2019.1599337. Epub 2019 Apr 12.
Korkosh VS, Kiselev AM, Mikhaylov EN, Kostareva AA, Zhorov BS. Atomic Mechanisms of Timothy Syndrome-Associated Mutations in Calcium Channel Cav1.2. Front Physiol. 2019 Mar 29;10:335. doi: 10.3389/fphys.2019.00335. eCollection 2019.
Perepelina K, Klauzen P, Kostareva A, Malashicheva A. Tissue-Specific Influence of Lamin A Mutations on Notch Signaling and Osteogenic Phenotype of Primary Human Mesenchymal Cells. Cells. 2019 Mar 21;8(3):266 doi: 10.3390/cells8030266.
Knyazeva A, Krutikov A, Golovkin A, Mishanin A, Pavlov G, Smolina N, Hushkina A, Sejersen T, Sjoberg G, Galagudza M(, Kostareva A. Time- and Ventricular-Specific Expression Profiles of Genes Encoding Z-DiskProteins in Pressure Overload Model of Left Ventricular Hypertrophy. Front Genet. 2019 Jan 7;9:684. doi: 10.3389/fgene.2018.00684. eCollection 2018.
Zlotina A, Kiselev A, Sergushichev A, Parmon E, Kostareva A. Rare Case of Ulnar-Mammary-Like Syndrome With Left Ventricular Tachycardia and Lack of TBX3Mutation. Front Genet. 2018 Jun 15;9:209. doi: 10.3389/fgene.2018.00209.
Kiselev A, Vaz R, Knyazeva A, Khudiakov A, Tarnovskaya S, Liu J , Sergushichev A, Kazakov S, Frishman D, Smolina N, Pervunina T, Jorholt J, Sjoberg G, Vershinina T, Rudenko D, Arner A, Sejersen T, Lindstrand A, Kostareva A. De novo mutations in FLNC leading to early-onset restrictive cardiomyopathy and congenital myopathy. Hum Mutat. 2018 Jun 1. doi: 10.1002/humu.23559 PMID: 29858533
Karonova T, Grineva E, Belyaeva O, Bystrova A, Jude EB, Andreeva A, Kostareva A, Pludowski P. Relationship Between Vitamin D Status and Vitamin D Receptor Gene Polymorphisms With Markers of Metabolic Syndrome Among Adults. Front Endocrinol 2018 16;9:448. doi: 10.3389/fendo.2018.00448. PMID: 301966978

Монографии

Андрющенко А.В., Арутюнов Г.П., Атьков О.Ю., Балахонова Т.В., Баранова Е.И., Большакова О.О., Васичкина Е.С., Васюк Ю.А. и др. Кардиология. Национальное руководство. Краткое издание. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2018. — 816 с. ISBN 978-5-9704—4387-3
Акчурин Р.С., Алексеева Ю.А., Алекян Б.Г., Андрианов А.В., Андрияшкин В.В., Андрющенко А.В., Анисимов С.В., Аронов Д.М., Арутюнов Г.П., Атьков О.Ю., Бабенко А.Ю., Балахонова Т.В., Баранова Е.И., Баранцевич Е.Р., Беленков Ю.Н., Березина А.В., Большакова О.О., Бубнова М.Г., Васичкина Е.С., Васюк Ю.А. и др. Кардиология: национальное руководство. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2015. — 800 с. ISBN 978-5-9704—2845-0
Семернин Е.Н., Гудкова А.Я., Крутиков А.Н., Козленок А.В., Беркович О.А., Ситникова М.Ю., Костарева А.А., Шавловский М.М. Поражение сердца при гемохроматозе (алгоритмы диагностики и врачебная тактика). СПб: Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. академика И.П. Павлова, 2014. – 52 с.
Семернин Е.Н., Гудкова А.Я., Шляхто Е.В., Костарева А.А., Баранова Е.И., Рудакова Т.Л. Первичные и вторичные кардиомиопатии» (Морфо-функциональные и клинико-генетические параллели. Современное представление). Пособие для студентов старших курсов, клинических ординаторов и врачей-кардиологов. СПб: Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. академика И.П. Павлова, 2008 – 76 с.

Патенты

Патент № 2554056 от 20.06.2015, заявка № 2013140523/10 от 03.09.2013.
«Набор синтетических олигонуклеотидов для определения нуклеотидной последовательности кодирующей части генов NKX2.5, CFC1, GATA4 и выявления мутаций, ассоциированных с орфанной моногенной патологией, лежащей в основе семейных форм врожденных пороков сердца».
Авторы: Костарева А.А., Злотина А.М., Ходюченко Т.А., Урусова М.Е., Киселёв А.М.
Патент № 2556832 от 20.07.2015, заявка № 2013127027/10 от 06.06.2013
«Набор синтетических олигонуклеотидов для определения нуклеотидной последовательности кодирующей части гена DES и выявления мутаций, ассоциированных с десминовыми кардиомиопатиями».
Авторы: Костарева А.А., Смолина Н.А., Малашичева А.Б., Урусова М.Е., Киселёв А.М.
Патент № 2529947 от 10.10.2014, заявка № 2012152110/10 от 05.12.2012.
«Способ получения культуры гладкомышечных клеток»
Авторы: Малашичева А.Б., Костарева А.А., Зверев Д.А., Костина Д.А., Успенский В.Е., Гордеев М.Л., Урусова М.Е.
Патент № 2206893 от 20.06.2003, заявка № 2002120645/14 от 29.07.2002.
«Способ диагностики гипертрофической кардиомиопатии».
Авторы: Гудкова А.Я., Мамаев Н.Н., Семернин Е.Н., Рыбакова М.Г., Костарева А.А., Шляхто Е.В.

Программы для ЭВМ и баз данных