НИЛ популяционной генетики
НИЛ популяционной генетики
Заведующий лабораторией — PhD Артемов Никита Николаевич (Mykyta Artomov).
Основные задачи
Направления работы
Исследования лаборатории посвящены двум главным направлениям: идентификации врожденных рисков полигенных заболеваний и их особенностей̆ в российской̆ популяции, а также разработке новых вычислительных методов работы с геномными данными.
Основной фокус исследований сосредоточен на прогнозировании манифестации метаболических нарушений с помощью анализа геномных данных глубоко-профилированных когорт пациентов.
Описание проектов
- Получение стандартизованных данных по генотипированию национальной популяционной когорты для использования в биомедицинcких целях.
- Углубленный анализ генотип-фенотипических корреляций и выявление новых потенциальных направлений профилактики хронических неинфекционных заболевания полигенной природы с целью создания персонифицированных профилактических программ.
Структура
Лаборатория состоит из клинического подразделения (под руководством О. П. Ротарь) и подразделения вычислительной генетики.
Список сотрудников
Участие в международных научных проектах
Акция скрининга артериального давления МММ17, МММ18, МММ19 — главной целью всемирного скрининга является повышение информированности населения и улучшение выявляемости, лечения артериальной гипертензии.
Исследование ESH-SHOT (определение риска инсульта при оптимальном лечении артериальной гипертензии) направлено на медицинскую и социально важную проблему оптимизации вторичной профилактики инсульта, участие в проекте с 2013 года.
Исследование TRIPLE A study (усовершенствование подходов к оценке сосудистой жесткости) направлено на оценку влияния метаболического синдрома и его отдельных компонентов на биомеханические свойства артерий и здоровье сосудов в различных возрастных категориях.
Участие в грантах
- Государственный контракт № 06/303 от 18.05.2008 г. «Метаболический синдром: эпидемиология, факторы риска, генетические маркеры и возможности оптимизации терапии у лиц трудоспособного возраста».
- Государственный контракт № 16.740.11.0175 от 02.09.2010 г. «Молекулярно-генетические детерминанты, ассоциированные с метаболическим синдромом и его компонентами, в российской популяции».
- Государственный контракт № К-32-НИР/111-5 от 24.10.2011 г. «Выявление новых факторов риска, механизмов развития осложнений, путей профилактики и лечения метаболического синдрома».
- Президентский грант Минобрнауки России «Разработка персонифицированных подходов к терапии артериальной гипертензии с учетом молекулярно-генетических и цитокиновых маркеров, нейрогенных влияний, органных поражений и метаболических расстройств», сроки выполнения 2018-2019 гг.
Основные публикации сотрудников
- Artomov M., Rivas M. A., Genovese G., Daly M. J. (2017). “Mosaic Mutations in Blood DNA Sequence are Associated with Solid Tumor Cancers.” npj Genomic Medicine 2(22). (Impact Factor = 5.802)
- Artomov M., Stratigos A. J., Kim I., Njauw C. N., Shannon K., Gragoudas E. S., Lane A. M., Lauss M., Kumar R., Miao B., Jonsson G., Daly M. J., Tsao H. (2017). “Rare variant, gene-based association study of hereditary melanoma using whole exome sequencing.” Journal of the National Cancer Institute 109(12). (Impact Factor = 11.641)
- Yu H., Artomov M., Brahler S., Stander C., Shamsan G., Sampson M. G., White M. J., Kretzler M., Miner J. H., Jain S. Winkler C. A., Mitra R. D., Kopp J. B., Daly M. J., Shaw AS (2016). “A role for genetic susceptibility in sporadic focal segmental glomerulosclerosis”. Journal of Clinical Investigations 126(4): 1603. (Impact Factor = 11.864) * - equal contribution (co-first authorship)
- Gupta S., Artomov M., Goggins W., Daly M. J., Tsao H. (2015). “Gender Disparity and Mutation Burden in Metastatic Melanoma”. Journal of the National Cancer Institute 107(11). (Impact Factor = 11.641)
- Rotar O. P., Boyarinova M. A., Moguchaya E. V., Kolesova E. P., Erina A. M., Solntsev V. N., Konradi A. O., Shlyakhto E. V. Subclinical target organ damage in subjects with different components of metabolic syndrome // Clinical and Experimental Hypertension. - 2017 - Vol.10. - P.1-6.
- Bhatt D. L., Steg P. G., Miller M., Brinton E. A., Jacobson T. A., Ketchum S. B., Doyle R. T. Jr., Juliano R. A., Jiao L., Granowitz C., Tardif J. C., Ballantyne C. M.; REDUCE-IT Investigators. Cardiovascular Risk Reduction with Icosapent Ethyl for Hypertriglyceridemia. N Engl J Med. 2019 Jan 3;380(1):11-22.
- Usoltsev D., Sitnikova V., Kajava A., Uspenskaya M. FTIR Spectroscopy Study of the Secondary Structure Changes in Human Serum Albumin and Trypsin under Neutral Salts. Biomolecules 2020, 10, 606. https://doi.org/10.3390/biom10040606
- Usoltsev D., Sitnikova V., Kajava A., Uspenskaya M. Systematic FTIR Spectroscopy Study of the Secondary Structure Changes in Human Serum Albumin under Various Denaturation Conditions. Biomolecules 2019, 9, 359. https://doi.org/10.3390/biom9080359
- Tyler K. Ulland, Wilbur M. Song, Stanley Ching-Cheng Huang, Jason D. Ulrich, Alexey Sergushichev, Wandy L. Beatty, Alexander A. Loboda, Yingyue Zhou, Nigel J. Cairns, Amal Kambal, et al. Trem2 maintains microglial metabolic fitness in alzheimer’s disease. Cell, 170(4):649–663, 2017
- Javlon E. Isomurodov, Alexander A. Loboda and Alexey A. Sergushichev. Ranking vertices for active module recovery problem. In International Conference on Algorithms for Computational Biology, pages 75–84. Springer, 2017.
- Alexey A. Sergushichev, Alexander A. Loboda, Abhishek K. Jha, Emma E. Vincent, Edward M. Driggers, Russell G. Jones, Edward J. Pearce, and Maxim N. Artyomov. Gam: a web-service for integrated transcriptional and metabolic network analysis. Nucleic acids research, 44(W1):W194–W200, 2016.
- Alexander A. Loboda, Maxim N. Artyomov and Alexey A. Sergushichev. Solving generalized maximum-weight connected subgraph problem for network enrichment analysis. In International Workshop on Algorithms in Bioinformatics, pages 210–221. Springer, 2016.
Контакты
Артемов Никита Николаевич, заведующий НИЛ
e-mail: artemov_nn@almazovcentre.ru
