Инфекционные заболевания, микробная и антимикробная терапия

Направления исследований

Исследование предрасположенности к заболеванию, тяжелому течению, вариантам исходов и различной степени эффективности терапии при COVID-19.
Исследование роли микробиоты в патогенезе различных заболеваний и персонифицированная микробная терапия с помощью пробиотиков и аутопробиотиков.

Разработка вакцины для профилактики и терапии инфекций, вызванных SARS-СoV-2.
Инновационные вакцины для профилактики инфекционных осложнений у пациентов с хронических обструктивными заболеваниями легких.
Разработка новых антибиотиков для борьбы с внутрибольничными инфекциями на основе природных антимикробных пептидов и бактериофагов.
Разработка подходов к мониторингу формирования эпидемических штаммов возбудителей нозокомиальных инфекций с множественной лекарственной устойчивостью в условиях пандемии COVID-19 и в постэпидемический период.
Персонифицированная микробная терапия как подход к коррекции соматических патологий (метаболический синдром и диабет 2 типа).

Ожидаемые результаты

Будет сформирована единая база данных больных COVID-19 с параметрами клинических проявлениях, особенностей течения, лабораторных результатов, в том числе гормональных, и исходов нарушений, возникающих на фоне новой коронавирусной инфекции с целью поиска предикторов, включая молекулярно-генетические, и особенностей развития, течения и исходов на фоне и после инфекции COVID-19.

Будет выполнен анализ структурных и морфологических изменений органов, включая легкие, сердце, центральную и периферическую нервную систему, поджелудочную и щитовидную железы и др. с целью получения данных иммуногистохимической характеристики поврежденных тканей, сосудистого русла, локализации вируса в клетках.

Будет разработана оптимальная иммунологическая панель, необходимая для оценки степени тяжести и прогноза COVID-19.

Будет изучен вклад кишечного микробиома в постпрандиальный гликемический ответ у беременных с гестационным сахарным диабетом.

Будет исследована возможность применения аутопрробиотиков для коррекции нежелательных последствий химиотерапии у пациентов с онкогематологической патологией.

Будет проведено in silico моделирование вакцинных конструкций, содержащих различные белки вируса SARS-CoV-2. Будет осуществлен химический синтез целевых генов SARS-CoV-2.

Будут проведены доклиническое и клинические исследования вакцинного препарата: вирус-бактериальной вакцины против Streptococcus pneumoniae, сочетающей бактериальные антигены и антигены вируса гриппа в составе живой пробиотической вакцины.

Будут проведено исследование точечной превалентности колонизации респираторного тракта микроорганизмами с множественной лекарственной устойчивостью у пациентов с COVID-19.

Будет исследован препарат вакцинного кандидата — живой вирус-бактериальной вакцины с модифицированным бактериальными антигенами белком гемагглютинина на предмет специфической активности в отношении вируса гриппа и пневмококковой инфекции.

Будет создана коллекция штаммов бактериофагов, активных в отношении ванкомицин устойчивых энтерококков.

Будет проведена апробация метода полногеномного секвенирования при расследовании нескольких острых и хронических эпидемических вспышек, связанных с гликопептид-резистетными микроорганизмами, в частности VRE; при секвенировании геномов штаммов микроорганизмов, формирующих «тайм-серию» в пределах острой или хронической вспышки, будет изучена генетическая вариабельность мобильных генетических элементов, детерминирующих синтез факторов патогенности и резистентности к антибиотикам; будет оценена эпидемиологическая эффективность применения метода полногеномного секвенирования в рутинной практике микробиологического мониторинга госпитальных штаммов в медицинских организациях стационарного типа.

Будут проведены исследования по персонифицированному подбору аутопробиотиков кардиологическим пациентам с метаболическим синдромом с использованием результатов метагеномного анализа их микробиоты.

Будет создан протокол исследования и подобраны пациенты с хронической обструктивной болезнью легких, которые получат различные варианты вакцинных препаратов (вакцинный препарат на основе рекомбинантного белка, содержащего поверхностные антигены пневмококков в составе вакцинного препарата PSPF, либо живую пробиотическую вакцину с белком PSP на поверхности пробиотика, либо живую вирус-бактериальную вакцину).

Будет разработана диагностическая тест-система на основе набора бактериофагов с целью оптимизации фаговой терапии, а также оптимизированы алгоритмы терапии различных бактериальных инфекций с использованием антимикробных пептидов.

Будет оценена возможность применения методов высокопроизводительного секвенирования (NGS) в рутинной практике микробиологического мониторинга за формированием и распространением в стационарах госпитальных штаммов гликопептидрезистентных возбудителей инфекций, связанных с медицинской помощью.