Технология изучения транскриптома единичных клеток в исследовании аутоиммунных заболеваний

Количество пациентов, страдающих от аутоиммунных и аутовоспалительных заболеваний, увеличивается год от года. Для совершенствования подходов к диагностике таких заболеваний необходимо проведение углубленного анализа особенностей функционирования иммунной системы пациентов с применением своевременных молекулярно-генетических методов исследования и клеточного анализа. Проведение этих исследований позволит с новых позицией подойти к пониманию патогенеза (условий и механизмов возникновения и прогрессирования) аутоиммунных и аутовоспалительных заболеваний, что в свою очередь, позволит разработать принципиально новые и эффективные подходы к их таргетной терапии.

Функциональное состояние иммунных клеток является ключевым для понимания их вовлеченности в патологический процесс. В настоящее время для этих целей разработан новый метод – анализ транскриптома единичных клеток, позволяющий оценивать функциональную активность каждой отдельно взятой клетки.

Научными сотрудниками НИЛ аутоиммунных и аутовоспалительных заболеваний НЦМУ «Центр персонализированной медицины» (направление «Неизвестные, редкие и генетически-обусловленные заболевания») проведено исследование 14 образцов мононуклеарных клеток периферической крови у пациентов с аутоиммунными и аутовоспалительными заболеваниями. Совместное исследование генетиков, молекулярных биологов и иммунологов позволило сопоставить результаты, полученные рутинными методами, описывающими субпопуляционный состав клеток, с вновь полученными результатами анализа трансриптома. Оказалось, что для каждой субпопуляции, даже самой малочисленной, характерен свой профиль функциональной активности. Проведена идентификация основных популяций: моноцитов, лимфоцитов и т.д. Кром того, использование новых подходов позволило выявить и оценить функциональную активность минорных субпопуляций клеток: Т-хелперов, Т-цитотоксических и т.д., то есть тех, которые осуществляют регуляцию деятельности всей иммунной системы, и нарушение функционирования которых, приводит к развитию аутоиммунных заболеваний.

Апробированный новый подход к исследованию функционального состояния клеток иммунной системы пациентов с аутоиммунными и аутовоспалительными заболеваниями позволит на молекулярном уровне изучить патогенез заболеваний, что даст возможность разработать и внедрить новые, ранние методы диагностики, а также принципиально новые методы терапии.
01.08.2023