Карасева Алена Борисовна

Младший научный сотрудник НИЛ вакцинопрофилактики инфекционных заболеваний НИО микробной терапии НОЦ «Молекулярные основы взаимодействия микроорганизмов и человека» НЦМУ «Центр персонализированной медицины».

Индекс Хирша РИНЦ — 5,
Индекс Хирша (WOS) — 2,
Индекс Хирша (Scopus) — 3,
Число публикаций — 27.

Orcid ID: 0000-0002-9570-4769

Основные научные интересы: геномика бактерий, мобильные генетические элементы, факторы патогенности бактерий, бактериальные антимикробные пептиды, пробиотики и аутопробиотики, микробиом человека.

Образование

В 2013 году окончила магистратуру биологического факультета СПбГУ по специальности «Микробиология».

Участие крупных отечественных и международных проектах

Стажировка в Institut national de la recherche agronomique (INRA), г. Нант, Франция, в рамках федеральной целевой программы N 14.616.21.0024 «Разработка новых антимикробных препаратов на основе энтерококковых бактериоцинов» (май 2015- сентябрь 2015).

Командировки в Тропический Российско-Вьетнамский центр, г. Ханой, Вьетнам в рамках Международной программы ИПЭЭ РАН по теме «Микробиота человека в условиях тропиков в норме и при патологии, профилактика и лечение инфекционных заболеваний» (ноябрь 2016 – декабрь 2016, май 2019, декабрь 2019).

Опыт участия в грантах

Грант Российского научного фонда (РНФ) № 16-15-10085 П, Оптимизация бактериального состава аутопробиотиков для восстановления кишечного микробиоценоза (продление сроков выполнения проекта), срок исполнения 2019-2020 год, исполнитель.
Грант Российского научного фонда (РНФ) № 16-15-10085, Оптимизация бактериального состава аутопробиотиков для восстановления кишечного микробиоценоза, срок исполнения 2016-2018 год, исполнитель.
Грант Российского фонда фундаментальных исследований (РФФИ), № 16-04-01737 А, Геномный полиморфизм и молекулярная эволюция мобильных генетических элементов эпидемических штаммов Enterococcus faecium, срок исполнения 2015-2017 год, исполнитель.
Грант Российского фонда фундаментальных исследований (РФФИ), № 14-04-00390 А, Сравнительная оценка роли белков Streptococcus pyogenes, рецепторных в отношении иммуноглобулинов классов A и G, в генезе поражений клубочкового аппарата почек и разработка технологии профилактики этих поражений, сроки выполнения, срок исполнения 2014-2016 год, исполнитель.
Исполнитель НИР в рамках государственного контракта № 14.N08.12.0021 2013-2015 г. «Доклинические исследования лекарственного средства на основе комплекса бифидобактерий, лактобацилл и энтерококков с установленной последовательностью генома для лечения неспецифического язвенного колита» (шифр заявки «2013-2.5-14-N08-0015-005»), в рамках федеральной целевой программы «Развитие фармацевтической и медицинской промышленности Российской Федерации на период до 2020 года и дальнейшую перспективу».
Грант Российского фонда фундаментальных исследований (РФФИ), № 13-04-01861 А, Влияние различных штаммов молочнокислых бактерий на микробиоту, пищеварение и иммунитет, срок исполнения 2013-2015 год, исполнитель.

Основные публикации

Tiwari S.K., Dicks L.M.T., Popov I.V., Karaseva A., Ermakov A.M., Suvorov A., Tagg J.R., Weeks R. and Chikindas M.L.. Probiotics at War Against Viruses: What Is Missing From the Picture? Front. Microbiol. – 2020. – 11:1877. doi: 10.3389/fmicb.2020.01877.
Ермоленко Е.И., Кудрявцев И.В., Соловьева О.И., Карасева А.Б., Цапиева А.Н., Кондратенко Ю.Д., Котылева М.П., Серебрякова М.К., Шумихина И.А., Суворов А.Н. Особенности субпопуляционного состава регуляторных Т-лимфоцитов и микробиоты кишечника при синдроме раздраженного кишечника. Медицинская иммунология. – 2020. – 22(2):335-346. https://doi.org/10.15789/1563-0625-POS-1905.
Борщев Ю.Ю., Буровенко И.Ю., Карасева А.Б., Минасян С.М., Борщев В.Ю., Семенова Н.Ю., Борщева О.В., Половинкин В.В., Родионов Г.Г., Суворов А.Н., Галагудза М.М. Моделирование синдрома системной воспалительной реакции химической индукцией травмы толстого кишечника у крыс Медицинская иммунология. – 2020. – Т. 22. № 1. С. 87-98.
Starikova E.A., Golovin A.S., Vasilyev K.A., Karaseva A.B., Serebriakova M.K., Sokolov A.V., Kudryavtsev I.V., Burova L.A., Voynova I.V., Suvorov A.N., Vasilyev V.B., Freidlin I.S. Role of arginine deiminase in thymic atrophy during experimental Streptococcus pyogenes infection. Scand J Immunol. – 2019. – 89(2):e12734. doi: 10.1111/sji.12734.
Цапиева А.Н., Боровкова Е.А., Карасева А.Б., Алиева Е.В., Суворов А.Н. Разработка метода идентификации индигенных лактобацилл кишечника при создании аутопробиотиков. Вопросы детской диетологии. 2019. Т. 17. № 3. С. 52-59.
Suvorov A., Karaseva A., Kotyleva M., Kondratenko Y., Lavrenova N., Korobeynikov A., Kozyrev P., Kramskaya T., Leontieva G., Kudryavtsev I., Guo D., Lapidus A. and Ermolenko E. Autoprobiotics as an Approach for Restoration of Personalised Microbiota. Front. Microbiol. – 2018. – 9:1869. doi: 10.3389/fmicb.2018.01869 https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2018.01869/full.
Starikova E.A., Golovin A.S., Vasilyev K.A., Karaseva A.B., Serebriakova M.K., Sokolov A.V., Kudryavtsev I.V., Burova L.A., Voynova I.V., Suvorov A.N., Vasilyev V.B., Freidlin I.S. Role of arginine deiminase in thymic atrophy during experimental Streptococcus pyogenes infection. Scand J Immunol. – 2019. – 89(2):e12734. doi: 10.1111/sji.12734. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/sji.12734.
Ermolenko E.I., Abdurasulova I.N., Kotyleva M.P., Matsulevich A.V., Karaseva A.B., Tarasova E.A., Sizov V.V., Suvorov A.N., Svirido D.A. Effects of indigenous enterococci on the intestinal microbiota and the behavior of rats on correction of experimental dysbiosis // Neuroscience and Behavioral Physiology. – 2018. – V. 48. No. 4. pp. 496-505. https://link.springer.com/article/10.1007/s11055-018-0591-7.