Научно-исследовательский центр неизвестных, редких и генетически обусловленных заболеваний

Заведующий центра — д.м.н. Васичкина Елена Сергеевна.

В рамках научно-исследовательского центра создан Центр компетенций «Наследственные, редкие и малоизученные заболевания», ориентированный на раннюю диагностику и лечение данных заболеваний.

Основные задачи центра

Проведение фундаментальных исследований, направленных на выявление новых конкретных генетических детерминант врожденной патологии и раскрытие молекулярных механизмов ее развития, создание экспериментальных клеточных и животных моделей для тестирования новых генно-инженерных и генно-терапевтических препаратов для лечения наследственных заболеваний.

Применение прорывных генетических технологий, включая eQTL-картирование, оценку экспрессионного и эпигенетического профилирования с целью раскрытия новых механизмов фенотипической реализации генетических поломок и разработки препаратов, направленных на нейтрализацию выявленных механизмов.

Создание научно-клинической биомедицинской экосистемы, осуществляющей разработку и внедрение в практику здравоохранения технологий диагностики и лечения заболеваний на основе персонализированной медицины, включая биомоделирование заболеваний, модификацию генома и создание препаратов для генной терапии и биомедицинских клеточных продуктов с применением технологий геномного редактирования для повышения качества лечения и снижения смертности при ряде генетически детерминированных сердечно-сосудистых заболеваний, аутоиммунных, а также редких и малоизученных.

Направления работы

Сотрудниками НИЦ реализуются 10 следующих проектов:

Использование мультиомиксных данных для диагностики редких генетических заболеваний.
Создание моделей генетически обусловленных заболеваний человека с использованием индуцированных плюрипотентных клеток (иПК).
Поиск новых направлений таргетной терапии при врожденных и приобретенных заболеваниях с избыточной кальцификацией.
Разработка подходов к созданию и персонифицированному использованию генотерапевтических препаратов при врожденных генетически обусловленных патологиях нейромышечной и сердечно-сосудистой систем.
Создание центра биомоделирования патологических процессов у грызунов и Danio rerio с использованием технологий редактирования генома.
Разработка персонифицированных технологий лечения семейной гиперхолестеринемии с учетом фено- и генотипических профилей пациентов.
Разработка и апробирование на широких группах населения детекторов на базе искусственного интеллекта для выявления детей с редкими, малоизученными врожденными заболеваниями с целью их ранней верификации.
Создание регистра неизвестных, редких и генетически обусловленных заболеваний.
Создание регистра врожденных генетически обусловленных кардиомиопатий у детей.
Исследование молекулярного механизма неклассических (немоногенных) аутовоспалительных заболеваний и поиск направлений для их таргетной терапии.

Структура центра

Разработанные и внедренные технологии

Технологии таргетного секвенирования нового поколения.
Сравнительная геномная гибридизация на ДНК-микрочипах (array-CGH).
Технологии редактирования генома.
Функциональные исследования с применением индуцированных плюрипотентных стволовых клеток.
Открыт новый источник и механизм специализации определённого типа стволовых клеток, который может быть использован в регенерации тканей человека.
Новый нерв-зависимый механизм специализации клеточных типов в раннем развитии.

Основные публикации сотрудников

Spatiotemporal structure of cell fate decisions in murine neural crest. Soldatov R., Kaucka M., Kastriti M. E., Petersen J., Chontorotzea T., Englmaier L., Akkuratova N., Yang Y., Häring M., Dyachuk V., Bock C., Farlik M., Piacentino M. L., Boismoreau F., Hilscher M. M., Yokota C., Qian X., Nilsson M., Bronner M. E., Croci L., Hsiao W. Y., Guertin D. A., Brunet J. F., Consalez G. G., Ernfors P., Fried K., Kharchenko P. V., Adameyko I. Science. 2019. DOI: 10.1126/science.aas9536.
Schwann cell precursors contribute to skeletal formation during embryonic development in mice and zebrafish. Xie M., Kamenev D., Kaucka M., Kastriti M. E., Zhou B., Artemov A. V., Storer M., Fried K., Adameyko I., Dyachuk V., Chagin A.S.. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2019. DOI: 10.1073/pnas.1900038116
Newton P. T., Li L., Zhou B., Schweingruber C., Hovorakova M., Xie M., Sun X., Sandhow L., Artemov A. V., Ivashkin E., Suter S., Dyachuk V., El Shahawy M., Gritli-Linde A., Bouderlique T., Petersen J., Mollbrink A., Lundeberg J., Enikolopov G., Qian H., Fried K., Kasper M., Hedlund E., Adameyko I., Sävendahl L., Chagin A.S. A radical switch in clonality reveals a stem cell niche in the epiphyseal growth plate. Nature. 2019. DOI: 10.1038/s41586-019-0989-6
Soldatov R., Kaucka M., Kastriti M. E., Petersen J., Chontorotzea T., Englmaier L., Akkuratova N., Yang Y., Häring M., Dyachuk V., Bock C., Farlik M., Piacentino M. L., Boismoreau F., Hilscher M. M., Yokota C., Qian X., Nilsson M., Bronner M. E., Croci L., Hsiao W. Y., Guertin D. A., Brunet J. F., Consalez G. G., Ernfors P., Fried K., Kharchenko P. V., Adameyko I. Spatiotemporal structure of cell fate decisions in murine neural crest. Science. 2019. DOI: 10.1126/science.aas9536.
Smolina N., Khudiakov A., Knyazeva A., Zlotina A., Sukhareva K., Kondratov K., Gogvadze V., Zhivotovsky B., Sejersen T., Kostareva A. Desmin mutations result in mitochondrial dysfunction regardless of their aggregation properties. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis. 2020; 24:165745. doi: 10.1016/j.bbadis.2020.165745. IF 4.352
Perepelina K., Klauzen P., Khudiakov A., Zlotina A., Fomicheva Y., Rudenko D., Gordeev M., Sergushichev A., Malashicheva A., Kostareva A. Generation of two iPSC lines (FAMRCi006-A and FAMRCi006-B) from patient with dilated cardiomyopathy and Emery-Dreifuss muscular dystrophy associated with genetic variant LMNAp.Arg527Pro. Stem Cell Res. 2020; 43:101714. doi: 10.1016/j.scr.2020.101714. IF 4.489
Khudiakov A., Perepelina K., Klauzen P., Zlotina A., Gusev K., Kaznacheyeva E., Malashicheva A., Kostareva A. Generation of two iPSC lines (FAMRCi004-A and FAMRCi004-B) from patient with familial progressive cardiac conduction disorder carrying genetic variant DSP p.His1684Arg. Stem Cell Res. 2020; 43:101720. doi: 10.1016/j.scr.2020.101720. IF 4.489
A. Malashicheva, A. Kostina, A. Kostareva, O. Irtyuga, M. Gordeev and V. Uspensky (2020). “Notch signaling in the pathogenesis of thoracic aortic aneurysms: A bridge between embryonic and adult states.” Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis 1866(3): 165631. https://doi.org/10.1016/j.bbadis.2019.165631 IF 4,3 Q1
Aquila G., Kostina A., Vieceli Dalla Sega F., Shlyakhto E., Kostareva A., Marracino L., Ferrari R., Rizzo P., Malaschicheva A 2019 The Notch pathway: a novel therapeutic target for cardiovascular diseases? Expert Opin Ther Targets 23:695–710. https://doi.org/10.1080/14728222.2019.1641198 IF 4,6, Q1
Klauzen P., Perepelina K., Khudiakov A., Zlotina A., Fomicheva Y., Pervunina T., Vershinina T., Kostareva A., Malashicheva A. Generation of two induced pluripotent stem cell lines (FAMRCi005-A and FAMRCi005-B) from patient carrying genetic variant LMNA p.Asp357Val. Stem Cell Res. 2020; 43:101719. doi: 10.1016/j.scr.2020.101719. IF 4.489
Olmastroni E., Tragni E., Casula M., Shlyakhto E. V., Konradi A. O., Rotar O. P., Alieva A. S., Boyarinova M. A., Baragetti A., Catapano A. L., Grigore L., Pellegatta F. Epidemiology Of Cardiovascular Risk Factors In Two Population-based Studies // Atherosclerosis, Supplements. 2018. Т. 35. С. e14-e20.

Патенты и изобретения

Контакты

Васичкина Елена Сергеевна, заведующий НИЦ
телефон: +7 (921) 935-18-90
e-mail: Vasichkina_ES@almazovcentre.ru