НИО генетических рисков и персонифицированной профилактики

Заведующий отделом — д.м.н. Бабенко Алина Юрьевна.

Основные задачи отдела

Поиск специфичных предикторов развития метаболических нарушений и сердечно-сосудистых событий в различных фенотипических и генотипических группах для разработки программ персонифицированной профилактики.

Создание базы исследований полигенных заболеваний в РФ и разработка методов прогнозирования метаболических нарушений.

Идентификация врожденных рисков полигенных заболеваний и их особенностей в российской популяции, а также разработке новых вычислительных методов работы с геномными данными.

Прогнозирование манифестации метаболических нарушений с помощью анализа геномных данных глубоко-профилированных когорт пациентов.

Направления работы

Получение стандартизованных данных по генотипированию национальной популяционной когорты для использования в биомедицинcких целях.
Разработка персонифицированных программ предикции рисков при сердечно-сосудистой патологии на основе омиксных технологий.
Углубленный анализ генотип-фенотипических корреляций и выявление новых потенциальных направлений профилактики хронических неинфекционных заболеваний полигенной природы с целью создания персонифицированных профилактических программ.

Структура

НИЛ технологий прогнозирования риска развития сердечно-сосудистых осложнений

Научно-исследовательская группа острого коронарного синдрома

НИЛ популяционной генетики
НИЛ предиабета и метаболических нарушений
НИЛ метаболических заболеваний и микробиоты

Основные публикации

Usoltsev D., Sitnikova V. E., Kajava A. V., Uspenskaya M. V. FTIR Spectroscopy Study of the Secondary Structure Changes in Human Serum Albumin and Trypsin under Neutral Salts // Biomolecules - 2020, Vol. 10, No. 4, pp. 606; Skitchenko R.K., Usoltsev D., Uspenskaya M.V., Kajava A.V., Guskov A. Census of halide-binding sites in protein structures // Bioinformatics - 2020, Vol.36, No. 10, pp. 3064-3071
Metsker O., Magoev K., Yakovlev A., Yanishevskiy S., Kopanitsa G., Kovalchuk S. and Krzhizhanovskaya V. Identification of risk factors for patients with diabetes: diabetic polyneuropathy case study. BMC Medical Informatics and Decision Making (2020) 20:201 https://doi.org/10.1186/s12911-020-01215-w
Savicheva A., Tapilskaya N., Vorobiev S., Kirichek R., Pirmagomedov R., Rybind M., et al. Secure application of graphene in medicine. GYNECOLOGICAL ENDOCRINOLOGY 2020, VOL. 36, NO. S1, S48–S52 https://doi.org/10.1080/09513590.2020.1816717
Korostovtseva L., Alieva A., Rotar O., Bochkarev M., Boyarinova M., Sviryaev Y., Konradi A. and Shlyakhto E. Sleep Duration, Lipid Profile and Insulin Resistance: Potential Role of Lipoprotein(a). Int. J. Mol. Sci. 2020, 21, 4680; doi:10.3390/ ijms21134680
Lebedev D. A., Lyasnikova E. A., Vasilyeva E. Yu , Babenko A. Yu. and Shlyakhto E. V. Type 2 Diabetes Mellitus and Chronic Heart Failure with Midrange and Preserved Ejection Fraction: A Focus on Serum Biomarkers of Fibrosis. Journal of Diabetes Research Volume 2020, Article ID 6976153, 9 pages https://doi.org/10.1155/2020/6976153 IF 3.04
Heyne H. O., Artomov M., Battke F., Bianchini C., Smith D. R., Liebmann N., Tadigotla V., Stanley C. M., Lal D., Rehm H., Lerche H., Daly M. J., Helbig I., Biskup S., Weber Y. G., Lemke JR (2019).“Targeted gene sequencing in 6994 individuals with neurodevelopmental disorder with epilepsy.”Genetics in Medicine 21 (11), 2496-2503
Kontsevaya A., Shalnova S., Deev A., Breda J., Jewell J., Rakovac I., Conrady A., Rotar O., Zhernakova Y., Chazova I., Boytsov S. Overweight and Obesity in the Russian Population: Prevalence in Adults and Association with Socioeconomic Parameters and Cardiovascular Risk Factors. Obes Facts. 2019;12(1):103-114.
Nikitin D., Kolosov N., Murzina A., Pats K., Zamyatin A., Tkachev V., Sorokin M., Kopylov P., Buzdin A. Retroelement-Linked H3K4me1 Histone Tags Uncover Regulatory Evolution Trends of Gene Enhancers and Feature Quickly Evolving Molecular Processes in Human Physiology. Cells 2019,8,1219. doi: https://doi.org/10.3390/cells8101219
Babenko A. Yu., Savitskaya D. A., Kononova Yu. A., Trofimova A. Yu., Simanenkova A. V., Vasilyeva E. Yu., Shlyakhto E. V. Predictors of Effectiveness of Glucagon-Like Peptide-1 Receptor Agonist Therapy in Patients with Type 2 Diabetes and Obesity. Journal of Diabetes Research. Vol 2019, Article ID 1365162, 12 pages IF 3.04
Babenko A., Mosikian A., Lebedev D., Khrabrova E., Shlyakhto E. Mental state, psychoemotional status quality of life and treatment compliance in patients with type 2 diabetes mellitus. Journal of Comparative Effectiveness Research. 2019; 8 (2): 113-120. (Published Online:14 Dec 2018, Vol.8, N2). IF 1,906
Smolyanskaya О. А., Lazareva E. N., Nalegaev S. S., Petrov N. V., Zaytsev K. I., Timoshina P. A., Tuchina D. K., Toropova Ya. G., Kornyushin O. V., Babenko A. Yu., Guillet J.P., Tuchin V. V. Multimodal Optical Diagnostics of Glycated Biological Tissues. ISSN 00062979, Biochemistry (Moscow). 2019, Vol. 84, Suppl. 1, pp. S124S143. © Pleiades Publishing, Ltd., 2019. IF 1,704
Erina A. M., Rotar O. P., Solntsev V. N., Shalnova S. A., Deev A. D., Baranova E. I., Konradi A. O., Boytsov S. A., Shlyakhto E. V. Epidemiology of arterial hypertension in Russian Federation — Importance of choice of criteria of diagnosis. Kardiologiya Volume 59, Issue 6, 2019, Pages 5-11
Магрук М. А., Мосикян А. А., Бабенко А. Ю. Биомаркеры, ассоциированные с атерогенезом: актуальный статус и перспективные направления. Российский кардиологический журнал. 2019;24 (12):148–152 doi:10.15829/1560 — 4071-2019-12-148-152 IF 1,305
Rotar O. P., Boyarinova M. A., Moguchaia E. V., Kolesova E. P., Erina A. M., Solntsev V. N., Konradi A. O., Shlyakhto E. V. Subclinical target organ damage in subjects with different components of metabolic syndrome. Clinical and Experimental Hypertension. 2018. Т. 40. № 5. С. 421-426.
Zykov V. A., Tuchina T. P., Lebedev D. A., Babenko A. Y., Kuleshova E. V., Grineva E. N., Bayramov A. A., Galagudza M. M. Effects of glucagon-like peptide 1 analogs in combination with insulin on myocardial infarct size in rats with type 2 diabetes mellitus. World J Diabetes. 2018 WoS, Scopus Vol. 9 Issue 9 рр.:149-156. doi: 10.4239/wjd.v9.i9.149. IF 1,576
Zhang T., Demchenko P. S., Khodzitskiy M. K., Kononova Yu. A., Babenko A.Y., Grineva E. N. The influence of bilirubin and creatinine on the refractive index of whole blood in terahertz frequency range: a qualitative analysis // Proceedings of SPIE. — 2018. — Vol. 10820. — pp. 108200P doi: 10.1117/12.2500855 IF 0,56
Тихоненко Е. В., Цой У. А., Васильева Е. Ю., Бабенко А. Ю. Характеристики пищевого поведения и уровень гормонов, регулирующих аппетит у пациентов с сахарным диабетом 2 типа и индексом массы тела выше 35 кг/м2. Ожирение и метаболизм. 2018; Том 15 № 1 стр.30-38 -254doi: 10.14341/DM9586
Тихоненко Е. В., Бабенко А. Ю., Шляхто Е. В. Предикторы эффективности терапии агонистами рецепторов глюкагоноподобного пептида-1 у пациентов с сахарным диабетом 2 типа и ожирением. Ожирение и метаболизм. 2018;15 (4): 21-29.

Контакты

Бабенко Алина Юрьевна, заведующий НИО
e-mail: babenko_ayu@almazovcentre.ru