Научно-исследовательский центр персонализированной онкологии

Заведующий центра — д.м.н. Самочерных Константин Александрович.

Основные задачи центра

Научная значимость фундаментальных разработок в области онкологии в рамках работы НЦМУ «Центр персонализированной медицины» определяется использованием новейших технологий экспрессионного анализа, включая технологию геномного анализа единичных клеток (single cell sequencing) в сочетании с эпигенетическим профилированием и высокопроизводительным секвенированием.

Данные о геномной структуре солидных опухолей и опухолей кроветворной системы, полученные с использованием материала существующих и будущих биоресурсных коллекций, в сочетании с возможностью детального фенотипирования пациентов на базе входящих в Консорциум медицинских центров позволят разработать новые критерии, определяющие химио- и радиочувствительность опухолей, создать генно-диагностические системы и новые генно-инженерные препараты для терапии онкозаболеваний, определить новые генетические маркеры для персонифицированной направленной терапии ряда опухолей.

Важным разделом программы в части «Онкология» является исследование фундаментальных механизмов действия препаратов на основе создания химерных антигенных рецепторов, применение генно-модифицированных иммунных клеток и поиск методов создания биомедицинских клеточных продуктов подобного рода.

Направления работы

Молекулярно-генетическое профилирование при опухолях ЦНС с целью персонификации комплексной терапии.
Поиск новых молекулярно-генетических маркеров прогноза клинического течения нейроэндокринных опухолей.
Молекулярное профилирование опухолей и пограничных новообразований поджелудочной железы и панкреатобилиарной зоны для определения персонифицированной хирургический и химиотерапевтический тактики.
Т-лимфоциты с химерным антигенным рецептором для терапии колоректальных опухолей c использованием новой методологии биспецифичных рецепторов.
Т-лимфоциты с химерным антигенным рецептором для терапии множественной миеломы с использованием нового типа костимулирующих доменов.
Иммунологические маркеры как предикторы ответа на ингибиторы тирозинкиназ и мишени для терапии при миелопролиферативных заболеваниях.
Технология секвенирования отдельных клеток (single cell sequencing) как метод определения опухолевой гетерогенности и стратегии терапии.
Изучение иммунологического ландшафта острых лейкозов для создания индивидуального иммунологического профиля пациента с целью персонификации терапии на основе данного профиля.
Разработка методов повышения эффективности и безопасности гаплоидентичной трансплантации костного мозга на основании изучения особенностей иммунного восстановления и клеточных иммуноадаптивных технологий.
Разработка пептидного препарата RAS70 против мембранно-связанного HSP70 на раковых клетках для таргетной интраоперационной диагностики злокачественных новообразований.
Разработка и создание онколитических бактериальных и вирусных штаммов для терапии новообразований кишечника, панкреатобилиарной зоны, а также опухолей головного мозга.
Создание линейки радиофармацевтических препаратов для определения лучевого фенотипа злокачественных опухолей различных локализаций с целью персонификации противоопухолевого лечения.
Разработка подхода к повышению отдаленных результатов лечения онкологических пациентов путем персонифицированной микробной терапии.
Исследование роли микробиоты в развитии и прогрессировании новообразований женской половой сферы.
Разработка нейросетевого алгоритма для ранней диагностики опухолей женской репродуктивной системы (рака шейки матки) на основе кольпоскопического скрининга.
Создание программ анализа эндо-ультразвуковых видео- и фотоизображений на основе искусственного интеллекта для повышения диагностической точности.
Развитие персонифицированных малоинвазивных и паллиативных эндоскопических методик для лечения опухолей панкреатобилиарной зоны и эндоскопического введения химиопрепаратов.
Персонализация ведения онкологических больных с целью сохранения фертильности.
Разработка персонифицированной системы поддержки принятия решений для определения тактики у пациентов со злокачественными новообразованиями различной локализации и тяжелой сопутствующей сердечно-сосудистой патологией.

Структура центра

НИЛ нейроэндокриннных опухолей

НИГ тераностики

НИО иммуноонкологии

НИО трансляционной онкологии

Основные публикации сотрудников

Genetic polymorphisms associated with rheumatoid arthritis development and antirheumatic therapy response. Mikhaylenko D. S., Nemtsova M. V., Bure I. V., Deviatkin A.A., Zamyatnin A.A. International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21(14), р. 1-17.
Antihypertensive effect of amlodipine in co-administration with omeprazole in patients with hypertension and acid-related disorders: Cytochrome P450-associated aspects. Dorofeeva M. N., Shikh E. V., Sizova Z. M., Grishina E. A., Sychev D. A. Pharmacogenomics and Personalized Medicine, 2019, 12, р. 329-339
Roles of e-cadherin and noncoding rnas in the epithelial–mesenchymal transition and progression in gastric cancer. Bure I. V., Nemtsova M. V., Zaletaev D. V. International Journal of Molecular Sciences, 2019, 20(12), 2870 Q1
Epigenetic changes in the pathogenesis of rheumatoid arthritis. Nemtsova M. V., Zaletaev D. V., Bure I.V., Lukashev A. N., Zamyatnin A. A. Frontiers in Genetics, 2019, 10(JUN), 570 Q1
Antihypertensive effect of amlodipine in co-administration with omeprazole in patients with hypertension and acid-related disorders: Cytochrome P450-associated aspects. Dorofeeva M. N., Shikh E. V., Sizova Z. M., Grishina E. A., Sychev D. A. Pharmacogenomics and Personalized Medicine, 2019, 12, р. 329-339
Long noncoding RNA HOTAIR is upregulated in an aggressive subgroup of gastrointestinal stromal tumors (GIST) and mediates the establishment of gene-specific DNA methylation patterns. Bure I., Geer S., Knopf J., Haller F., Moskalev E.A. Genes Chromosomes and Cancer, 2018, 57(11), с. 584-597
А. И. Циберкин, У. А. Цой, В. Ю. Черебилло, А. В. Полежаев, Н. В. Курицына, А. А. Пальцев, А. В. Алхазишвили, Е. Н. Гринева. Раннее послеоперационное определение уровня гормона роста для прогнозирования результатов хирургического лечения при акромегалии.// Терапевтический архив.- 2020.-Том 92. №10. – С. 48–53. DOI: 10.26442/00403660.2020.10.000490
Циберкин А. И., Цой У. А., Черебилло В. Ю., Курицына Н. В., Пальцев А. А., Полежаев А. В., Гринева Е. Н. Различные способы определения гормона роста в раннем послеоперационном периоде для прогнозирования ремиссии акромегалии после транссфеноидальной аденомэктомии.// РМЖ.- 2020. № 1.- С.6-9.
Курицына Н., Лаврищева Ю., Цой У., Черебилло В., Пальцев А., Васильева Е., Литвиненко Е., Гринева Е. Предикторы ремиссии болезни Кушинга после транссфеноидальной эндоскопрической аденомэктомии // Врач . – 2019-Т. 30, №8. - С.29-32 ИФ-0,615
Циберкин А. И., Цой У. А., Черебилло В. Ю., Полежаев А. В., Гуссаова Н. В., Гринева Е. Н. Оценка результатов транссфеноидальной аденомэктомии при акромегалии с применением различных критериев ремиссии.//Вопросы нейрохирургии им. Н. Н. Бурденко.- 2019. Т. 83. № 1.- С. 98-104. DOI: 10.17116/neiro20198301198
Яневская Л. Г., Каронова Т. Л., Слепцов И. В., Борискова М. Е., Бахтиярова А. Р., Иванова Е. В., Погосян К. А., Фарафонова У. В., Андреева А. Т., Цой У. А., Гринёва Е. Н. Первичный гиперпаратиреоз: клинические формы и их особенности. Результаты ретроспективного исследования.//Клиническая и экспериментальная тиреоидология.- 2019. Т. 15. № 1.- С. 19-29. doi: 10.14341/ket10213
Neumann H. P. H., Tsoy U., Bancos I., Amodru V., Walz M. K., Tirosh A., et al; International Bilateral-Pheochromocytoma-Registry Group (Grineva E.N. among the International Bilateral-Pheochromocytoma-Registry Group). Comparison of Pheochromocytoma-Specific Morbidity and Mortality among Adults with Bilateral Pheochromocytomas Undergoing Total Adrenalectomy vs Cortical-Sparing Adrenalectomy.//JAMA Network Open. - 2019. Aug 2;2(8):e198898. DOI: 10.1001/jamanetworkopen.2019.8898
Criteria for the definition of Pituitary Tumor Centers of Excellence (PTCOE): A Pituitary Society Statement. Casanueva F. F., Barkan A. L., Buchfelder M., Klibanski A., Laws E. R., Loeffler J. S., Melmed S., Mortini P., Wass J., Giustina A.; Pituitary Society, Expert Group on Pituitary Tumors.Pituitary. 2017 Oct;20(5):489-498. doi: 10.1007/s11102-017-0838-2.
Shuvalov O., Kizenko A., Petukhov A., Aksenov N., Fedorova O., Vorobev M., Daks A., Barlev N. Cancer-testis antigens, semenogelins 1 and 2, exhibit different anti-proliferative effects on human lungadenocarcinoma cells. Cell Death Discov. 2020;6:108. doi: 10.1038/s41420-020-00336-5. eCollection 2020. PubMed PMID: 33101710; PubMed Central PMCID: PMC7581521.
Fedorova O., Daks A., Shuvalov O., Kizenko A., Petukhov A., Gnennaya Y., Barlev N. Attenuation of p53 mutant as an approach for treatment Her2-positive cancer. Cell Death Discov. 2020;6:100. doi: 10.1038/s41420-020-00337-4. eCollection 2020. Review. PubMed PMID: 33083021; PubMed Central PMCID: PMC7548004.
Vasileva E., Shuvalov O., Petukhov A., Fedorova O., Daks A., Nader R., Barlev N. KMT Set7/9 is a new regulator of Sam68 STAR-protein. Biochem Biophys Res Commun. 2020 May 14;525(4):1018-1024. doi: 10.1016/j.bbrc.2020.03.017. Epub 2020 Mar 13. PubMed PMID: 32178870.
Titov A., Valiullina A., Zmievskaya E., Zaikova E., Petukhov A., Miftakhova R., Bulatov E., Rizvanov A. Advancing CAR T-Cell Therapy for Solid Tumors: Lessons Learned from Lymphoma Treatment. Cancers (Basel). 2020 Jan 3;12(1). doi: 10.3390/cancers12010125. Review. PubMed PMID: 31947775; PubMed Central PMCID: PMC7016531.
Efimova O. A., Koltsova A. S., Krapivin M. I., Tikhonov A. V., Pendina A. A. Environmental Epigenetics and Genome Flexibility: Focus on 5-Hydroxymethylcytosine. International Journal of Molecular Sciences. 2020;21(9):3223.
Sharma N., Fonin A. V., Shpironok O. G., Silonov S. A., Turoverov K. K., Uversky V. N. Folding perspectives of an intrinsically disordered transactivation domain and its single mutation breaking the folding propensity. Int. J. Biomacromol, 2019.
Shevtsov M., Stangl S., Nikolaev B., Yakovleva L., Marchenko Y., Tagaeva R., Sievert W., Pitkin E., Mazur A., Toltoy P., Galibin O., Ryzhov V., Steiger K., Smirnov O., Khachatryan W., Chester K., Multhoff G. Granzyme B functionalized nanoparticles targeting membrane Hsp70-positive tumors for multimodal cancer theranostics. Small. 2019; 15(13):e1900205. WoS IF = 10.856, Q1
Goryaynov S. A., Okhlopkov V. A., Golbin D. A., Chernyshov K. A., Svistov D. V., Martynov B. V., Kim A. V., Byvaltsev V. A., Pavlova G. V., Batalov A., Konovalov N. A., Zelenkov P. V., Loschenov V. B., Potapov A. A. Fluorescence Diagnosis in Neurooncology: Retrospective Analysis of 653 Cases. Front Oncol. 2019;9:830. WoS IF = 4.848, Q1
Shevtsov M., Sato H., Multhoff G., Shibata A. Novel approaches to improve the efficacy of immuno-radiotherapy. Frontiers in Oncology. 2019;9:156. WoS IF = 4.25, Q1
Shevtsov M., Pitkin E., Ischenko A., Stangl S., Khachatryan W., Galibin O., Edmond S., Lobinger D., Multhoff G. Ex vivo Hsp70-activated NK cells in combination with PD-1 inhibition significantly increase overall survival in preclinical models of glioblastoma and lung cancer. Frontiers in Immunology. 2019;10:454. WoS IF = 4.716, Q1
Stangl S., Tei L., De-Rose F., Reder S., Martinelli J., Sievert W., Shevtsov M., Öllinger R., Rad R., Schwaiger M., Alessandria C.D., Multhoff G. Preclinical evaluation of the Hsp70 peptide tracer TPP-PEG24-DFO[89Zr] for tumor-specific PET/CT imaging. Cancer Research. 2018;78(21):6268-628. WoS IF = 8.378, Q1
Shevtsov M., Nikolaev B., Marchenko Y., Yakovleva L., Skvorzov N., Mazur A., Tolstoy P., Ryzhov V., Multhoff G. Targeting experimental glioblastoma with chitosan-based superparamagnetic iron oxide nanoparticles (CS-DX-SPIONs). International Journal of Nanomedicine. 2018;13:1471-1482. WoS IF = 4.471, Q1
Stangl S., Tontcheva N., Sievert W., Shevtsov M., Niu M., Schmid T. E., Pigorsch S., Combs S. E., Haller B., Balermpas P., Rödel F., Rödel C., Fokas E., Krause M., Linge A., Lohhaus F., Baumann M., Tinhofer I., Budach V., Stuschke M., Grosu A.L., Abdollahi A., Debus J., Belka C., Maihöfer C., Mönnich D., Zips D., Multhoff G. Heat shock protein 70 and tumor-infiltrating NK cells as prognostic indicators for patients with squamous cell carcinoma of the head and neck after radiochemotherapy: A multicentre retrospective study of the German Cancer Consortium Radiation Oncology Group (DKTK-ROG). International Journal of Cancer. 2018;142(9):1911-1925. WoS IF = 4.982, Q1
Shevtsov M. A., Parr M. A., Ryzhov V. A., Zemtsova E. G., Ponomareva A. N., Smirnov V. M., Multhoff G. Zero-valent Fe confined mesoporous silica nanoparticles (Fe(0)@MCM-41) for targeting experimental orthotopic glioma in rats. Scientific Reports. 2016;6:29247. WoS IF = 4.011, Q1
Marina V. Filimonova, Victoria M. Makarchuk, Ljudmila I. Shevchenko, Alina S. Saburova, Valentina I. Surinova, Olga S. Izmestieva, Anatoly A. Lychagin, Vyacheslav O. Saburov, Petr V. Shegay, Andrey D. Kaprin, Sergey A. Ivanov, Alexander S. Filimonov / Radioprotective Activity of the Nitric Oxide Synthases Inhibitor T1023. Toxicological and Biochemical Properties, Cardiovascular and Radioprotective Effects // Radiation Research, 2020, принята к публикации 3.08.20.
Saburova A. S., Filimonova M. V., Yuzhakov V. V., Shevchenko L. I., Yakovleva N. D., Bandurko L. N., Koretskaya A. E., Fomina N. K., Saburov V. O., Filimonov A. S. / The influence of nitric oxide synthases inhibitor Т1023 on the development of radiation pneumofibrosis in rats // Radiatsionnaya Gygiena, 2020, 13(1), р. 60-67 DOI: 10.21514/1998-426Х-2020-13-1-60-67
Alexeev A. A., Nurieva E. V., Trofimova T. P., Chesnakova E. A., Grishin Y. K., Lyssenko K. A., Filimonova M. V., Zefirova O. N. / Bicyclic bridged isothioureas: synthesis and evaluation of activity in a model of lipopolysaccharide-induced septic shock // Mendeleev Communications, 2019, 29(1), p. 14-16 DOI: 10.1016/j.mencom.2019.01.003
Nurieva E. V., Trofimova T. P., Alexeev A. A., Proshin A. N., Chesnakova E. A. d., Grishin Y. K., Lyssenko K. A., Filimonova M. V., Bachurin S. O., Zefirova O. N. / Synthesis and antihypotensive properties of 2-amino-2-thiazoline analogues with enhanced lipophilicity // Mendeleev Communications, 2018, 28(4), с. 390-392 DOI: 10.1016/j.mencom.2018.07.016
Filimonova M. V., Podosinnikova T. S., Samsonova A. S., Makarchuk V. M., Shevchenko L. I., Filimonov A. S. / Comparison of Antitumor Effects of Combined and Separate Treatment with NO Synthase Inhibitor T1023 and PDK1 Inhibitor Dichloroacetate // Bulletin of Experimental Biology and Medicine, 2019, 168(1), p. 92-94 DOI: 10.1007/s10517-019-04655-1
Efimenko I. A., Filimonova M. V., Churakov A. V., Ivanova N. A., Erofeeva O. S., Samsonova A. S., Podosinnikova T. S., Filimonov A. S. / First Polynuclear Palladium Compounds [(C5H12NO)(PdCl3)]n and [(C10H16NO)2(Pd2Cl6)] with High Antitumor and Radioprotective Activity // Russian Journal of Coordination Chemistry/Koordinatsionnaya Khimiya, 2020, 46(5), р. 339-349 DOI: 10.1134 / S1070328420040028
Filimonova M. V., Shevchenko L. I., Makarchuk V. M., Chesnakova E. A., Shevchuk A. S., Filimonov A. S., Kryzhanovskii S. A. / Vasopressor Properties of No Synthase Inhibitor T1059. Part II. Hemodynamic Effects on Hypovolemic Disorders // Pharmaceutical Chemistry Journal, 2020, 53(12), р.1113-1117 DOI: 10.1007/s11094-020-02132-y
Makarchuk V. M., Filimonova M. V., Filimonov A. S., Shevchenko L. I., Izmestieva O. S., Saburova A. S. / Lactatemia as a possible pharmacological marker of NOS-inhibitor T1023 induced radioresistance / Radiation and Risk, 2020, 29(1), р. 45-56 DOI: 10.21870 / 0131-3878-2020-29-1-45-56
Filimonova M. V., Evstratova E. S., Makarchuk V. M., Shevchenko L. I., Filimonov A. S., Petin V. G. / Involvement of Recovery Processes in the Effects of Radioprotectors at the Cellular and Organismal Levels // Biology Bulletin, 2019, 46(12),p. 1619-1624 DOI: 10.1134/S1062359019120033
Филимонова М. В., Южаков В. В., Филимонов А. С., Макарчук В. М., Бандурко Л. Н., Корнеева Т. С., Самсонова А. С., Цыганова М. Г., Шевченко Л. И., Севанькаева Л. Е., Фомина Н. К., Ингель И. Э., Яковлева Н. Д / Сравнительное исследование влияния ингибитора NOS Т1023 и бевацизумаба на рост и морфологию карциномы легких Льюис // Пат. физиол. экспер. терапия. 2019. Т. 63, № 2. С. 89-98 DOI: 10.25557/0031-2991.2019.02.89-98
Филимонова М. В., Макарчук В. М., Шевченко Л. И., Филимонов А. С. / Исследование влияния ингибитора NOS Т1023 в сочетании с γ-излучением и циклофосфамидом на рост и метастазирование карциномы лёгких Льюис // Пат. физиол. экспер. терапия. 2019. Т. 63, № 3. С. 105-109 DOI: 10.25557/0031-2991.2019.03.105-109
Filimonova M. V., Shevchenko L. I., Makarchuk V. M., Chesnakova E. A., Surinova V. I., Shevchuk A. S., Filimonov A. S., Kryzhanovskii S. A., Shevchenko T. F., Bugrova A. E., Kalamkarov G. R. / Vasopressor Properties of Nitric Oxide Synthase Inhibitor T1059. Part I: Synthesis, Toxicity, NOS-Inhibition Activity, and Hemodynamic Effects Under Normotensive Conditions // Pharmaceutical Chemistry Journal, 2018, 52(4), с. 294-298 DOI: 10.1007/s11094-018-1809-2
Filimonova M. V., Samsonova A. S., Korneeva T. S., Shevchenko L. I., Filimonov A. S. / Study of the ability of a new nitric oxide synthase inhibitor INOS1 to selectively protect the normal tissue in the Ehrlich carcinoma radiotherapy model // Radiation and Risk, 2018, 27(2), с. 37-45 DOI: 10.21870 / 0131-3878-2018-27-2-37-45
Filimonova M. V., Samsonova A. S., Korneeva T. S., Shevchenko L. I., Saburov V. O., Filimonov A. S. / The radioprotective effects of nitric oxide synthase inhibitor T1023 on normal and malignant tissues // Radiation and Risk, 2018, 27(2), с. 37-45 DOI: 10.21870 / 0131-3878-2018-27-4-155-169
Simakova M. A., Karpova D. V., Marukyan N. V. et. al Dual-energy computed tomography-angiography in the evaluation and management of significant multiple pulmonary vein stenoses following atrial fibrillation ablation Pulmonary Circulation 2020; 10(4) 1–3 DOI: 10.1177/2045894020969499
Дьяченко М. А., Симакова М. А., Коростовцева Л. С. и др. Нарушения дыхания во сне у больных с легочной артериальной гипертензией и хронической тромбоэмболической легочной гипертензией Артериальная гипертензия. 2020 -Т. 26. № 1. - С. 85-93.
Симакова М. А., Моисеева О. М. Стимуляторы растворимой гуанилатциклазы в терапии пациентов с хронической тромбоэмболической легочной гипертензией: новые данные. Рациональная фармакотерапия в кардиологии. 2020. - Т. 16. № 2. -С. 317-323.
Гончарова Н. С., Симакова М. А., Моисеева О. М. Антитромботическая терапия у пациентов с легочной артериальной гипертензией Артериальная гипертензия. 2019. -Т. 25.№ 1. -С. 25-33.
Авдеев С. Н., Вавилова Т. В., Гончарова Н. С., Карелкина Е. В., Карпова Д. В., Нифонтов Е. М., Новиков В. К., Симакова М. А., Яковлев А. Н., Моисеева О. М. Европейские рекомендации по диагностике и лечению острой тромбоэмболии легочной артерии 2019 года: комментарии специалистов Российского Кардиологического и Респираторного обществ. Артериальная гипертензия. 2019. -Т. 25.№ 6. -С. 584-603.
Симакова М. А., Рыжков А. В., Казымлы А. В. и др. Перспективы использования показателей жесткости легочной артерии для оценки прогноза больных с легочной артериальной гипертензией. Терапевтический архив. 2018. - Т. 90. № 1. - С. 86-92.
Симакова М. А., Карпова Д. В., Моисеева О. М и др. Тромбэндартерэктомия из легочной артерии у пациента с хронической тромбоэмболической легочной гипертензией в условиях длительного циркуляторного. Кардиология и сердечно-сосудистая хирургия. 2018. -Т. 11. № 3. - С. 63-69.
Antuganov D., Zykov M., Timofeev V. et al.
Copper‐mediated radiofluorination of aryl pinacolboronate esters: a straightforward protocol by using pyridinium sulfonates.
European journal of organic chemistry. 2019; 5: 918–922. DOI:10.1002/ejoc.201801514.
Antuganov D., Timofeev V., Timofeeva K. et al.
Evaluation of protic ionic liquids based on triethanolammonium and Tris (hydroxymethyl) methylammonium salts as buffers for Ga-68-radiolabelling of PSMA-HBED-CC.
Chemistry select. 2019; 4 (43): 12524–12527. DOI: 10.1002/slct.201902588.
Antuganov D., Antuganova Y., Zykova T. et al.
Use of capillary electrophoresis for the determination of impurities in preparations of fluorine-18 labelled PET radiopharmaceuticals.
Journal of pharmaceutical and biomedical analysis. 2019; 173: 68–74. DOI: 10.1016/j.jpba.2019.05.016.
Antuganov D., Zykov M., Timofeeva K. et al.
Effect of Pyridine Addition on the Efficiency of Copper-Mediated Radiofluorination of Aryl Pinacol Boronates.
2017; 2 (26): 7909–7912. DOI.10.1002/slct.201701628.
Муртазалиева П. М., Рыжкова Д. В., Иртюга О. Б. и др.
Позитронная эмиссионная томография с [18F]-фторидом натрия и [18F]-фтордезоксиглюкозой в оценке клапанного воспаления и кальцификации у пациентов с аортальным стенозом.
Российский кардиологический журнал. 2019; 24 (12): 33–38.
Рыжкова Д. В., Пойда М. Д.
ПЭТ-КТ с [68GA]-ПCMA-11 в оценке первичного опухолевого очага и диагностике рецидива рака предстательной железы.
Вопросы онкологии. 2018; 64 (6): 799–804.

Контакты

Самочерных Константин Александрович, заведующий НИЦ
e-mail: samochernykh_ka@almazovcentre.ru